如何在Ubuntu16.04上安装R

来自菜鸟教程
跳转至:导航、​搜索

介绍

R 是一种流行的开源编程语言,专门用于统计计算和图形。 它广泛用于开发统计软件和执行数据分析。 R 易于扩展,社区以不断为特定研究领域添加用户生成的包而闻名,这使其适用于许多领域。

在本教程中,我们将安装 R 并展示如何从官方 Comprehensive R Archive Network (CRAN) 添加包。

先决条件

接下来,您将需要一个 Ubuntu 16.04 服务器:

  • 至少 1GB 的 RAM
  • 具有 sudo 权限的非 root 用户。 要了解如何设置它,请按照我们的 初始服务器设置指南

一旦这些先决条件到位,您就可以开始了。

第 1 步 — 安装 R

R 是一个快速发展的项目,最新的稳定版本并不总是可以从 Ubuntu 的存储库中获得,所以我们将从添加 CRAN 维护的外部存储库开始:

注意: CRAN 在其网络中维护存储库,但并非所有外部存储库都是可靠的。 请务必仅从受信任的来源安装。


sudo apt-key adv --keyserver keyserver.ubuntu.com --recv-keys E298A3A825C0D65DFD57CBB651716619E084DAB9
OutputE298A3A825C0D65DFD57CBB651716619E084DAB9
gpg: requesting key E084DAB9 from hkp server keyserver.ubuntu.com
gpg: key E084DAB9: public key "Michael Rutter <marutter@gmail.com>" imported
gpg: Total number processed: 1
gpg:               imported: 1  (RSA: 1)

一旦我们在每个服务器的数据库中获得了可信密钥,我们就可以添加存储库。

sudo add-apt-repository 'deb [arch=amd64,i386] https://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu xenial/'

我们需要在此之后运行 update 以包含来自新存储库的包清单:

sudo apt-get update
Output. . .
Get:6 https://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu xenial/ InRelease [3,590 B]
Get:7 https://cran.rstudio.com/bin/linux/ubuntu xenial/ Packages [31.5 kB]
. . .

如果上面的行出现在 update 命令的输出中,我们已经成功添加了存储库。 我们可以确定我们不会意外安装旧版本。

现在我们准备安装 R:

sudo apt-get install r-base

在撰写本文时,CRAN 的最新稳定版本为 3.3.1,当您启动 R 时会显示该版本。 由于我们计划为系统上的每个人安装示例包,我们将以 root 用户身份启动 R,以便所有用户都可以自动使用这些库:

sudo -i R
OutputR version 3.3.1 (2016-06-21) -- "Bug in Your Hair"
. . .
Type 'demo()' for some demos, 'help()' for on-line help, or
'help.start()' for an HTML browser interface to help.
Type 'q()' to quit R.
>

这确认我们已经成功安装了 R 并进入了它的交互式 shell。

第 2 步 — 从 CRAN 安装 R 包

R 的部分优势在于丰富的附加包。 出于演示目的,我们将安装 txtplot,这是一个输出 ASCII 图形的库,包括散点图、折线图、密度图、acf 和条形图:

install.packages('txtplot')

作为安装过程的一部分,您可以选择安装镜像:

Output--- Please select a CRAN mirror for use in this session ---
HTTPS CRAN mirror

1: 0-Cloud [https]                 2: Algeria [https]
3: Australia (Melbourne) [https]   4: Australia (Perth) [https]
5: Austria [https]                 6: Belgium (Ghent) [https]
7: Brazil (SP 1) [https]           8: Bulgaria [https]
9: Canada (MB) [https]            10: Chile [https]
11: China (Beijing 4) [https]      12: Colombia (Cali) [https]
13: Czech Republic [https]         14: Denmark [https]
15: France (Lyon 1) [https]        16: France (Lyon 2) [https]
17: France (Marseille) [https]     18: France (Paris 2) [https]
19: Germany (Falkenstein) [https]  20: Germany (Münster) [https]
21: Iceland [https]                22: Ireland [https]
23: Italy (Padua) [https]          24: Japan (Tokyo) [https]
25: Malaysia [https]               26: Mexico (Mexico City) [https]
27: New Zealand [https]            28: Norway [https]
29: Philippines [https]            30: Russia (Moscow) [https]
31: Serbia [https]                 32: Spain (A Coruña) [https]
33: Spain (Madrid) [https]         34: Switzerland [https]
35: Taiwan (Chungli) [https]       36: Turkey (Denizli) [https]
37: UK (Bristol) [https]           38: UK (Cambridge) [https]
39: UK (London 1) [https]          40: USA (CA 1) [https]
41: USA (IA) [https]               42: USA (KS) [https]
43: USA (MI 1) [https]             44: USA (TN) [https]
45: USA (TX) [https]               46: USA (WA) [https]
47: (HTTP mirrors)

Selection: 1

我们为 0-Cloud 输入了 1,它将我们连接到 RStudio 提供的内容交付网络 (CDN),以便获得地理上最接近的选项。 此镜像将被设置为会话剩余部分的默认值。 退出 R 并重新进入后,系统会提示您再次选择镜像。

注意: 在镜像列表之前,以下输出显示了软件包的安装位置。

OutputInstalling package into ‘/usr/local/lib/R/site-library’
(as ‘lib’ is unspecified)
. . .

这个站点范围的路径是可用的,因为我们以 root 身份运行 R,并且是使包对所有用户可用的正确位置。


安装完成后,我们可以加载txtplot

library('txtplot')

如果没有错误消息,则库已成功加载。 现在让我们通过一个示例来看看它的实际效果,该示例演示了一个带有轴标签的基本绘图功能。 示例数据由 R 的 datasets 包提供,包含基于 1920 年代数据的汽车速度和停车所需距离:

txtplot(cars[,1], cars[,2], xlab = "speed", ylab = "distance")
Output
      +----+-----------+------------+-----------+-----------+--+
  120 +                                                   *    +
      |                                                        |
d 100 +                                                   *    +
i     |                                    *                *  |
s  80 +                          *         *                   +
t     |                                       * *    *    *    |
a  60 +                          *  *      *    *      *       +
n     |                        *         * *  * *              |
c  40 +                *       * *    *  *    * *              +
e     |         *      *  * *  * *  *                          |
   20 +           *    *  * *       *                          +
      |  *      *    *                                         |
    0 +----+-----------+------------+-----------+-----------+--+
           5          10           15          20          25
                                speed

如果您有兴趣了解有关 txtplot 的更多信息,请使用 help(txtplot)。

任何预编译的包都可以使用 install.packages() 从 CRAN 安装。 要了解有关可用内容的更多信息,您可以在任何 mirror 上的 Packages 链接下找到按名称或发布日期组织的官方软件包列表。

结论

现在您已经成功安装了 R,您可能会对 安装开源 RStudio Server 的指南感兴趣,它是在远程 Linux 服务器上运行的 R 版本的接口,它将 IDE 带到您刚刚完成的基于服务器的部署。 您可能也有兴趣学习如何 直接从 GitHub、BitBucket 或其他位置 安装,以利用活跃社区的最新工作。